* Piano: Han har nevnt å spille piano i intervjuer og har til og med opptrådt på det i noen av rollene sine.
* Gitar: Han har blitt sett spille gitar i noen av TV-opptredenene sine, og har til og med opptrådt med et band.
* trommer: Han har vist frem sine trommeferdigheter i noen få opptredener.
* Ukulele: Han har en ukulele hjemme og har vist interesse for å lære den.
Selv om han ikke er en profesjonell musiker, ser det ut til at Neil Patrick Harris liker å spille forskjellige instrumenter for moro skyld og har til og med inkorporert dem i arbeidet sitt.