retningen hvor scenen beveger seg, avhenger av retningen av mikroskopet. Hvis mikroskopet er i oppreist stilling , vil scenen bevege seg i samme retning som kontrollknappen. Hvis du for eksempel dreier kontrollknappen for x-aksen til høyre, vil scenen flyttes til høyre. Hvis mikroskopet er i omvendt posisjon , vil scenen bevege seg i motsatt retning av kontrollknappen. For eksempel, hvis du dreier x-aksens kontrollknott til høyre, vil scenen flyttes til venstre.
De koaksiale trinnkontrollene er plassert på fronten av mikroskopet, under scenen. De er vanligvis to knotter, en for x-aksen og en for y-aksen. Noen mikroskoper har også en z-aksekontroll , som er plassert på siden av mikroskopet.
De koaksiale trinnkontrollene brukes til å flytte prøven på scenen slik at den kan sees under mikroskopet. Ved å flytte scenen kan du få forskjellige deler av prøven til syne. Du kan også bruke scenekontrollene til å sentrere prøven under objektivlinsen.