Her er noen viktige eksempler:
* De vises stein: Den sentrale konflikten dreier seg om trusselen om at Lord Voldemort forsøker å stjele steinen for å gjenvinne makten hans.
* Den forbudte skogen: De står overfor fare fra en trehodet hund som vokter steinen og forskjellige andre skapninger.
* Sjakkspillet: De må overvinne et gigantisk sjakkbrett der brikkene er livsstore og farlige.
* Felledørene: De møter mange feller i slottet, inkludert den beryktede "Devil's Snare".
* The Mirror of Erised: The Mirror of Erised (ønske stavet baklengs) frister Harry med bildet av foreldrene, noe som nesten får ham til å miste fokus på den sanne oppgaven.
* Professor Quirrell: De oppdager at den tilsynelatende harmløse professor Quirrell faktisk er besatt av Voldemort.
* Den endelige konfrontasjonen: Harry møter Quirrell og Voldemort, og risikerer sitt eget liv for å beskytte steinen.
Dette er bare noen få eksempler på de mange problemene de sto overfor. Gjennom hele boken viser Harry, Ron og Hermine mot, oppfinnsomhet og lojalitet i å overvinne disse hindringene.