Gideon forlot kriminelle sinn på slutten av sesong 2. Han trakk seg fra BAU etter å ha opplevd ekstrem PTSD etter fangst og tortur av en seriemorder.
Avgangen ble forklart i sesong 2-finalen, "Fisher King (del II)," der Gideon konfronterer traumene sine og bestemmer seg for at han trenger å prioritere sin egen velvære.
Han vises i senere sesonger, men bare i gjesteopptredener, som i episoden "The Fisher King" (sesong 5) og "The Replicator" (sesong 8).