* Thomas og vennene hans, Minho, Newt og Teresa, unnslipper endelig den fryktede labyrinten.
* De lærer sannheten om deres sanne hensikt:å tjene som subjekter i et grusomt eksperiment utført av WCKD, organisasjonen som skapte og kontrollerte labyrinten.
* Teresa avslører sin troskap til WCKD, noe som gjør Thomas knust og stiller spørsmål ved hvem han kan stole på.
* Gruppen, nå flyktninger, legger ut på en farlig reise over Scorch, en øde og forrædersk ødemark, på jakt etter den mytiske Safe Haven, et sted hvor de kan være fri fra WCKDs klør.
* Underveis møter de en rekke utfordringer, inkludert hensynsløse Cranks, voldsomme stormer og den alltid tilstedeværende trusselen fra skaperne.
* Til slutt når de Safe Haven, bare for å oppdage at det ikke er det de hadde håpet på. Det er et midlertidig tilfluktssted, kontrollert av en annen fraksjon som også forsøker å utnytte dem til sine egne formål.
* Thomas, Minho og Newt får vite sannheten om Flare, den dødelige sykdommen som herjet verden. De innser at de har nøkkelen til å finne en kur, takket være deres unike immunitet.
* Med nyvunnet besluttsomhet bestemmer de seg for å konfrontere WCKD og avslutte sitt terrorvelde en gang for alle. De legger ut på et siste oppdrag, og infiltrerer WCKDs hovedkvarter for å avsløre organisasjonens hemmeligheter og frigjøre de som har blitt fengslet og eksperimentert med.
* I en klimatisk kamp overvinner Thomas og vennene hans en rekke hindringer, møter deres dypeste frykt og ofrer alt for menneskehetens større beste.
* Til syvende og sist lykkes de med oppdraget sitt, å få ned WCKD og sikre en fremtid der folk kan leve fri fra klørne til manipulasjon og undertrykkelse.