* naruto: Naruto trente stort sett på egen hånd og bygde på ferdighetene han lærte av Jiraiya. Han fortsatte å avgrense sine Rasengan og andre teknikker, og fikk også nye evner som Sage Mode.
* Sasuke: Sasuke ble veiledet av Orochimaru, lærte forbudt jutsu og mestrer sin delingan. Senere, etter å ha slått fri fra Orochimarus kontroll, trente han under ledelse av Itachi Uchiha.
* Sakura: Sakura hadde ikke en dedikert mentor etter å ha forlatt landsbyen. Hun fokuserte stort sett på å forbedre sine medisinske ninjutsu og bekjempe ferdigheter gjennom sin egen praksis og erfaring. Hun lærte også av Kakashi, som hun trente med under sitt oppdrag å redde Sasuke.
Så mens det var individuelle tall som ledet dem i løpet av denne perioden, var det ikke et eneste team på tre mentorer for trioen. Treningen deres var fragmentert og var avhengig av deres individuelle mål og veier.