Her er et sammendrag av historien:
Percys verden blir snudd på hodet når han får vite at han er en halvgud. Han har alltid slitt på skolen, med lærevansker og blitt mobbet. Livet hans tar en dramatisk vending når hans pre-algebra-lærer blir til et monster, bestevennen hans forsvinner, og han blir anklaget for å ha stjålet Zevs lyn, en kraftig gjenstand som kan starte en krig mellom gudene.
Percy blir ført bort til Camp Half-Blood, en hemmelig treningsleir for halvguder. Her lærer han å kontrollere kreftene sine og møter andre halvguder som har vokst opp i dødelige miljøer. Han lærer om de gamle greske gudene og gudinnene, og om sin egen arv.
Percy, sammen med vennene sine Annabeth Chase (datter av Athena, visdommens gudinne) og Grover Underwood (en satyr som er Percys beskytter), må begi seg ut på et oppdrag for å rense Percys navn og finne det stjålne lynet. Denne farefulle reisen tar dem til underverdenen, hvor de møter mytiske skapninger og farlige utfordringer.
Boken kulminerer i en konfrontasjon med den sanne skurken bak tyveriet. Dette fører til en kamp som tester Percys evner og til slutt bestemmer skjebnen til både den dødelige og den guddommelige verden.
Percy Jackson og Lyntyven er en historie om selvoppdagelse, vennskap og å møte sin skjebne. Det er et spennende eventyr som blander gresk mytologi med moderne omgivelser, og skaper en unik og engasjerende verden for unge lesere.