- Klassisk musikk :Fagotten er et fremtredende instrument i klassisk musikk, hvor den ofte brukes til å spille basslinjen. Det er ofte omtalt i orkesterverk, kammermusikk og solostykker.
- Jazz :Fagotten brukes noen ganger i jazzmusikk, spesielt i storband. Den brukes ofte til å spille den gående basslinjen, som gir det rytmiske grunnlaget for bandet.
- Folkemusikk :Fagotten brukes av og til i folkemusikk, spesielt i tradisjonell europeisk folkemusikk. Det brukes ofte for å gi en dyp, susende lyd.
- Verdensmusikk :Fagotten brukes i en rekke verdensmusikksjangre, som afrikansk, asiatisk og latinamerikansk musikk. Det brukes ofte for å gi en lav, resonanslyd som støtter de andre instrumentene.
- Elektronisk musikk :Fagotten kan også brukes i elektronisk musikk, hvor den kan behandles og manipuleres for å skape en rekke unike lyder.