Klangen til en fløyte bestemmes av en rekke faktorer, inkludert materialene som brukes til å lage instrumentet, utformingen av instrumentet og måten det spilles på. Fløyter er vanligvis laget av tre eller metall, og de forskjellige materialene produserer forskjellige klangfarger. Trefløyter har en varmere, mer myk lyd, mens metallfløyter har en lysere, mer gjennomtrengende klang. Utformingen av fløyten påvirker også klangen. For eksempel har fløyter med større boring en mørkere, mer resonanslyd, mens fløyter med mindre boring har en lysere, mer fokusert klang. Måten en fløyte spilles på påvirker også klangfargen. For eksempel kan spillere bruke forskjellige embouchures (måten de danner leppene sine på) for å produsere forskjellige lyder. Spillere kan også bruke forskjellige artikulasjonsteknikker (måten de starter og stopper noter) for å produsere forskjellige effekter.
Klangen til en fløyte er en viktig del av dens musikalske identitet. Det er det som gir fløyten sin unike lyd og som gjør den til et så allsidig instrument. Fløyter brukes i et bredt spekter av musikalske sjangre, fra klassisk til jazz til rock.