1. Forsøk på å rekruttere Tamino: Nattens dronning dukker opp i begynnelsen av operaen, og søker hjelp fra den unge prinsen Tamino. Hun gir ham et magisk portrett av datteren Pamina og ber ham om å redde henne fra klørne til Sarastro, ypperstepresten i Visdomstempelet.
2. Gir magiske gjenstander: Nattens dronning utstyrer Tamino med en magisk fløyte og Papageno, fuglefangeren, med et magisk klokkespill. Disse magiske instrumentene er avgjørende for å hjelpe de to med å overvinne hindringer og fortrylle de de møter på reisen.
3. Plotter mot Sarastro: Nattens dronning nærer dyp harme mot Sarastro, som hun mener har bortført Pamina og holder henne mot hennes vilje. Hun prøver å manipulere og lure Tamino og Papageno for å jobbe mot Sarastro og hans tilhengere.
4. Setter prøveversjoner for Tamino: Tamino og Papageno gjennomgår flere prøvelser og utfordringer fremsatt av Sarastro. Nattens dronning prøver å gripe inn og påvirke disse prøvelsene, ved å bruke sin magi og list for å hindre deres suksess.
5. Konfrontasjon med Sarastro: I den klimaktiske scenen konfronterer Nattens Dronning Sarastro i tinningen hans, og anklager ham for forræderi og krever løslatelse av Pamina. Sarastro avslører den sanne naturen til intensjonene hans, som er edle og kloke i stedet for ondsinnede.
6. Nederlag og forvisning: Nattens dronning blir til slutt beseiret av Sarastro og styrkene hans. Hun er forvist fra lysets rike, og hennes makt er redusert. Datteren hennes Pamina blir gjenforent med Tamino, og de triumferer over mørkets krefter.