Kalsedon er den vanligste formen for kryptokrystallinsk kvarts. Begrepet "kryptokrystallinsk" betyr at krystallene som danner mineralet er så små at de ikke kan gjenkjennes med det blotte øye, og heller ikke under et vanlig mikroskop. Når det er tilstede som et kryptokrystallinsk aggregat i en fibrøs form, blir det edelstenen kjent som krysoprase.
Begrepet Kalsedon brukes i to spesifikke tilfeller:for det første for en spesifikk type mikrokrystallinsk struktur karakterisert ved vekslende fibrøse lag av kryptokrystallinsk kvarts; for det andre, mer bredt for å beskrive en rekke edelstener som passer til denne beskrivelsen, inkludert gjennomskinnelige varianter som Agat, Karneol, Krysopras, Jaspis og Onyx, samt noen ugjennomsiktige prøver.