Etter hendelsene i den originale anime-serien, blir Mustang transportert til en alternativ virkelighet, hvor han nå er militæroffiser i Tyskland. Han er hjemsøkt av minnene fra sin tid i Amestris og savner spesielt Hawkeye.
Filmen viser Mustang som sliter med sitt nye liv og lengter etter sine gamle venner, spesielt Hawkeye. Etter hvert får han vite at Hawkeye også har blitt transportert til denne alternative virkeligheten og leter etter ham. Han gjenforenes med Hawkeye mot slutten av filmen, og de deler endelig et øyeblikk med fred etter alt de har vært gjennom.