1. Super Junior-K.R.Y.:Denne underenheten består av tre medlemmer - Kyuhyun, Ryeowook og Yesung. De er kjent for sine sjelfulle ballader og kraftige vokal.
2. Super Junior-T:Denne undergruppen promoterer i Thailand og består av medlemmene Leeteuk, Heechul, Shindong, Sungmin og Eunhyuk. De fremfører sanger på både thai og koreansk.
3. Super Junior-M:Denne underenheten er primært aktiv i Kina og består av medlemmene Hangeng (tidligere medlem), Siwon, Donghae, Ryeowook, Kyuhyun og Zhou Mi. De fremfører sanger på mandarin-kinesisk.
4. Super Junior-H:Denne underenheten er kjent for sin travmusikk. Den består av medlemmene Leeteuk, Yesung, Kangin, Shindong, Sungmin og Eunhyuk. Trav er en tradisjonell koreansk musikksjanger preget av sitt raske tempo og positive rytmer.
5. Super Junior-D&E:Denne duoen består av medlemmene Donghae og Eunhyuk. De er kjent for sin fengende elektroniske dansemusikk og energiske opptredener.
6. Super Junior-Happy:Denne underenheten er preget av sin lyse og muntre musikk. Den består av medlemmene Yesung, Shindong, Sungmin og Leeteuk.
Disse undergruppene lar Super Junior utforske ulike musikalske stiler og konsepter mens de viser frem talentene og styrken til forskjellige medlemmer.