Her er en oppsummering av hva som skjer:
De foreldreløse Baudelaire blir sendt for å bo hos sin nye verge, Dr. Montgomery Montgomery, en herpetolog som er besatt av reptiler. Han bor i et falleferdig herskapshus fylt med slanger, øgler og andre skumle kryper.
Grev Olaf, forkledd som en reptilentusiast, bor også i huset, i håp om å stjele Baudelaire-formuen. Han prøver å lure barna til å gi ham pengene, men Violet, Klaus og Sunny er mistenksomme overfor motivene hans.
Dr. Montgomery Montgomery er en grusom og forsømmelig verge som ikke bryr seg om barnas velvære. Han tvinger dem til å delta i farlige reptileksperimenter og lar dem klare seg selv.
Barna oppdager et skjult rom i herskapshuset fylt med ledetråder om foreldrenes mystiske fortid. Denne informasjonen får dem til å tro at foreldrene deres var involvert i et hemmelig samfunn kalt VFD (Volunteers Fighting for Justice).
Grev Olaf forsøker å kidnappe Sunny, men barna rømmer ved hjelp av herskapshusets reptil, en giftig hoggorm ved navn Stephano.
Barna er skilt igjen, noe som gjør at de lurer på om de noen gang vil bli gjenforent.
Boken avsluttes med en cliffhanger, som lar leseren undre seg over hva som vil skje med de foreldreløse Baudelaire.
Nøkkeltemaer i boken:
* Faren ved å stole på voksne.
* Betydningen av familie og vennskap.
* Kraften til kunnskap og observasjon.
* Den pågående kampen mellom godt og ondt.
Totalt sett er "The Reptile Room" et spennende og spennende eventyr som utforsker de foreldreløse Baudelaires uheldige reise videre.