Hovedpersonene i showet, Zack og Cody Martin, er tvillingbrødre som er kjent for sin rampete oppførsel og ignorering av autoritet. Men etter hvert som serien skrider frem, begynner de å utvikle en større følelse av respekt og aktelse overfor jevnaldrende, lærere og foreldre.
Et eksempel på respekt i showet er Zack og Codys forhold til skipets kaptein, Mr. Moseby. I utgangspunktet er Zack og Cody stadig ulydig mot Mr. Mosebys regler og får problemer. Men etter hvert som serien skrider frem, begynner de å innse at Mr. Moseby ikke bare er en streng disiplinær, men også en omsorgsfull og ansvarlig voksen som ser etter deres beste. Som et resultat begynner Zack og Cody å vise mer respekt og aktelse overfor Mr. Moseby, og de blir til slutt nære venner.
Et annet eksempel på respekt i showet er Codys forhold til sin eldre bror, Zack. Zack er ofte den mer dominerende og utadvendte tvillingen, mens Cody er mer sjenert og reservert. Men etter hvert som serien skrider frem, begynner Cody å utvikle en sterkere følelse av selvtillit og selvsikkerhet. Han begynner å stå opp for seg selv og uttrykke meningene sine, selv om de er forskjellige fra Zacks. Som et resultat begynner Zack å vise mer respekt og aktelse overfor Cody, og de blir etter hvert nærmere brødre.
Samlet sett er aktelsestemaet et viktig tema i The Suite Life of Zack &Cody on Deck. Den viser hvordan karakterene lærer å respektere og sette pris på hverandre, og hvordan dette fører til sterkere relasjoner og et mer harmonisk bomiljø.