Det har imidlertid vært flere tilfeller der han ble antatt å være død , inkludert:
* The Death of Spider-Man-historien (1992-1993): Denne beryktede historiebuen så Spider-Man tilsynelatende drept av Green Goblin. Imidlertid ble det senere avslørt at nissen faktisk hadde drept en klon av Spider-Man, og den virkelige Peter Parker var fortsatt i live.
* The "One More Day"-historien (2007): Denne historien så Spider-Man inngå en avtale med djevelen Mephisto for å redde tante Mays liv. Som et resultat ble ekteskapet hans med Mary Jane Watson slettet fra eksistensen, og Spider-Man ble tilsynelatende alene og uten familie.
Mens disse hendelsene var store vendepunkter i Spider-Mans liv, overlevde han til slutt og fortsatte sine eventyr.
Det er viktig å merke seg at det har vært alternative realiteter og universer i Marvel Comics der Spider-Man har dødd, men disse hendelsene gjelder ikke hovedkontinuiteten.