Mens spionene strever etter å overliste hverandre, møter de komiske hindringer som gjør spionen deres til et sideshow av slapstick-komedie. Black Spy blir viklet inn i en gigantisk jojo, mens White Spy blir forfulgt av en sverm av gummihøns. Øyas flora og fauna blir med i galskapen, med snakkende papegøyer som håner spionenes hver eneste bevegelse og rampete aper som stjeler deres hemmelige planer.
Midt i det eskalerende kaoset snubler de to spionene over et skjult underjordisk laboratorium hvor de oppdager hjernen bak deres endeløse rivalisering:en rampete MAD-forsker ved navn Professor Wacko. Det viser seg at Wacko har orkestrert Spy vs Spy-oppdragene for sin egen underholdning, ved å bruke fjernstyrte forkledninger og lure gadgets for å holde spionene på jakt etter skygger.
I en klimascene som trosser logikk og fornuft, slår Black Spy og White Spy seg opp mot professor Wacko, og deltar i en gal kamp som involverer vaniljesaus, eksploderende sigarer og en gigantisk strikk. Til slutt blir spionene og vitenskapsmannen viklet inn i en kronglete vending av hendelser som gjør dem alle svimle og grundig beseiret.
Mens teppet faller for Spy vs Spy-eventyret, befinner agentene seg tilbake i sine respektive hovedkvarterer og lurer på om deres siste eskapade bare var en vill hallusinasjon. Med sine signaturglis trekker de på skuldrene og gjør seg klare for sitt neste oppdrag, vel vitende om at Spy vs Spy-verden alltid vil være fylt med sprø overraskelser og uforutsigbare vendinger.