Fjernsyn:
* The Rookie (2018 – nåtid): Sersjant "Nyla" Harper
* The Wire (2002-2008): Detektiv "Beadie" Russell
* Six Feet Under (2001–2005): Brenda Chenowith
* ER (1994-2009): Dr. Janet Coburn
* The X-Files (1993–2018): Dr. Anne Buckle
* The West Wing (1999–2006): Dr. Grace Barnett
* The Good Wife (2009–2016): Dommer Christine "Chrissy" Sexton
* Slott (2009–2016): Detektiv Ryan "Ritter" Russell
* Lov og orden:Special Victims Unit (1999-i dag): Ulike roller
* Grey's Anatomy (2005-i dag): Dr. Beth Hunter
* NCIS (2003-i dag): Dr. Wendy Kieffer
* Criminal Minds (2005–2020): Dr. Erica Rinehart
* Moderne familie (2009–2020): Sykepleier Pam
Film:
* The Sisterhood of the Travelling Pants (2005): Fru Gold
* The Perfect Score (2004): Fru Baker
* The Day After Tomorrow (2004): Dr. Lucy Hall
* The Prince of Tides (1991): Martha McMahon
* Thelma &Louise (1991): Carhop
* The Silence of the Lambs (1991): Kvinne på bensinstasjonen
* The Player (1992): Sekretær
Dette er bare en delvis liste, ettersom Amy Aquino har vært i mange andre prosjekter gjennom karrieren. Hun er en allsidig skuespillerinne med sterk tilstedeværelse på både det store og det lille lerretet.