Amerikanske myndigheter så på Ghost Dance som en potensiell kilde til uro og motstand. De forbød praksisen og forsøkte aktivt å undertrykke den. Dette forbudet anstrengte ytterligere det allerede anspente forholdet mellom stammene og regjeringen.
Situasjonen nådde et kritisk punkt i desember 1890 da en gruppe Lakota Sioux, ledet av Chief Big Foot, bestemte seg for å søke tilflukt ved Pine Ridge Indian Reservation. Den amerikanske hæren, under kommando av oberst James W. Forsyth, fanget opp og omringet dem nær Wounded Knee Creek.
Under forhandlinger lød et skudd, og det oppsto en spent konfrontasjon. De amerikanske troppene åpnet ild mot Lakota-leiren og massakrerte hundrevis av menn, kvinner og barn. Den tragiske hendelsen ble kjent som Wounded Knee Massacre.
Spøkelsesdansen hadde forsterket den åndelige gløden og besluttsomheten til Lakota Sioux. De så det som et siste håp å gjenvinne sin kulturelle og tradisjonelle livsstil. Imidlertid bidro den amerikanske regjeringens fiendtlige reaksjon på bevegelsen og dens forsøk på å undertrykke den til den flyktige atmosfæren som til slutt førte til den blodige konfrontasjonen ved Wounded Knee.