Til å begynne med var Henry en troende katolikk og fikk til og med tittelen "Troens forsvarer" fra pave Leo X for sine skrifter mot den protestantiske reformasjonen. Han var en trofast forsvarer av tradisjonelle katolske doktriner og praksis og var personlig motstander av kjetterske læresetninger. Imidlertid førte hans ønske om å annullere ekteskapet hans med Katarina av Aragon og gifte seg med Anne Boleyn til en konflikt med paven, som nektet å innvilge annulleringen.
Ute av stand til å oppnå den ønskede annulleringen fra Roma, tok Henry saken i egne hender. I 1534 vedtok han Act of Supremacy, som erklærte ham for å være den øverste lederen av Church of England og ga ham myndighet til å reformere den engelske kirken. Dette markerte det offisielle bruddet med den romersk-katolske kirke, og England ble en protestantisk nasjon.
Kong Henry spilte en aktiv rolle i utformingen av Church of Englands doktrine og liturgi. Han godkjente publiseringen av "De ti artikler" i 1536 og senere "Seks artikler" i 1539, som definerte den engelske kirkes teologiske og liturgiske praksis. Mens Church of England fortsatt opprettholdt mange katolske tradisjoner og ritualer, omfavnet den visse protestantiske prinsipper, som lesing av Bibelen på engelsk og vektlegging av rettferdiggjørelse ved tro.
Under Henrys regjeringstid var England vitne til betydelige religiøse endringer. Klostre og religiøse hus ble oppløst, og deres landområder og rikdom ble konfiskert av kronen. Kritikere og motstandere av Henrys religiøse politikk møtte forfølgelse, inkludert Thomas More og John Fisher, som ble henrettet for deres avslag på å anerkjenne kongens overherredømme over kirken.
I tillegg hadde Henrys religiøse politikk en dyp innvirkning på politiske, økonomiske og sosiale strukturer i England. Oppløsningen av klostre, for eksempel, resulterte i omfordeling av land og rikdom, og endret maktdynamikken mellom ulike samfunnsgrupper.
Gjennom hele livet opplevde kong Henry VIII flere endringer i sin religiøse tro og praksis. Mens han aldri fullt ut adopterte de mer radikale protestantiske doktrinene, flyttet han den engelske kirken bort fra katolisismen og mot en mer moderat protestantisk posisjon. Hans handlinger la til slutt grunnlaget for den anglikanske kirken, som vedvarer som den offisielle kirken i England i dag.