Escape of Sirius Black: Boken åpner med nyheten om at Sirius Black, en farlig kriminell og Harrys gudfar, har rømt fra Azkaban-fengselet. Det ryktes at Black er etter Harry, og legger til et nytt nivå av frykt til det allerede stressende miljøet.
Nye lærere og en mystisk fange: To nye lærere ankommer Galtvort:Remus Lupin, læreren i forsvaret mot mørkekunsten, og professor Trelawney, spådomslæreren. I mellomtiden blir en mystisk fange, antatt å være Sirius Black, holdt i slottet.
The Patronus Charm: Harry lærer den mektige Patronus-sjarmen fra Remus Lupin, som hjelper ham å bekjempe dementorene, vakter fra Azkaban som er tiltrukket av hans tristhet og frykt.
Sannheten om Sirius Black: Gjennom ulike ledetråder og møter oppdager Harry sannheten om Sirius Black. Han ble falskt anklaget for å forråde Harrys foreldre til Lord Voldemort, og hans egentlige oppdrag var å beskytte Harry.
Få sannheten i øynene: Harry må konfrontere sannheten om foreldrenes død og de virkelige motivene til Sirius Black, samt faren han utgjør for Harry.
Tidsvenderen: Hermione bruker en Time-Turner for å gå tilbake i tid og redde Sirius Black og Buckbeak, en hippogriff feilaktig dømt til døden. Dette fører til en rekke hendelser som endrer historiens gang.
Sett mot dementorene: Harry, Ron og Hermine konfronterer en gruppe dementorer, og bruker Patronus-sjarmen for å forsvare seg.
Den virkelige trusselen: Det avsløres at Peter Pettigrew, som alle trodde var død, faktisk er i live og har levd forkledd som Rons kjæledyrrotte, Scabbers. Pettigrew er den som forrådte Harrys foreldre, ikke Sirius Black.
Finalen: Med sannheten avslørt og den virkelige faren avslørt, konfronterer Harry, Ron og Hermine Peter Pettigrew, og redder Sirius Black i prosessen. Året avsluttes med en følelse av lettelse og nyvunnet forståelse.
Nøkkeltemaer: Boken utforsker temaer som svik, vennskap, rettferdighet og å konfrontere ens fortid. Den introduserer også nye karakterer, magiske skapninger og utvider magiens verden.