Gysis viktigste verk var boken hans, _Die Artikulation des Unterkiefers_ (1908), der han beskrev sine studier av anatomien og funksjonen til det temporomandibulære leddet. Han utviklet også flere instrumenter og teknikker for å måle okklusjon og artikulasjon, inkludert Gysi Simplex Artikulator .
Gysis arbeid hadde en dyp innvirkning på utviklingen av tannlegen, og han regnes for å være en av fedrene til moderne okklusjon og artikulasjon.
Her er en liste over noen av Alfred Gysis viktigste verk:
* _Anatomie der Kaumuskulatur_ (1897)
* _Die Artikulation des Unterkiefers_ (1908)
* _The problem of articulation_ (1910)
* _En lærebok i protetisk tannbehandling_ (1915)
* _Studier om underkjeveleddet_ (1929)
* _Der Kauapparat des Menschen_ (1940)
Gysis arbeid er oversatt til mange språk, og han har mottatt en rekke priser og utmerkelser for sine bidrag til tannlegen. Han regnes for å være en av de viktigste skikkelsene i tannlegens historie.