En høy Jacobsen-indeks indikerer et tre med mange korte indre grener, som kan være et resultat av en rask utstråling av taxa eller en høy karakterutvikling. En lav Jacobsen-indeks indikerer et tre med få korte indre grener, som kan være et resultat av en langsom stråling av taxa eller en lav karakterutvikling.
Jacobsen-indeksen brukes ofte til å sammenligne den relative forgreningen til forskjellige fylogenetiske trær, og kan brukes til å vurdere tilpasningen av forskjellige evolusjonsmodeller til et gitt datasett.