Mikroskopiens far er Anton van Leeuwenhoek, en nederlandsk handelsmann og vitenskapsmann som er mest kjent for sitt banebrytende arbeid innen mikroskopi og sine oppdagelser av mikroorganismer. Han var den første som observerte og beskrev bakterier, protozoer, sædceller og andre mikroskopiske organismer. Leeuwenhoek laget sine egne mikroskoper ved å slipe og polere bittesmå glasskuler, som han brukte for å oppnå forstørrelser på opptil 270 ganger. Han laget detaljerte tegninger og beskrivelser av sine observasjoner, som han publiserte i en serie brev til Royal Society of London. Arbeidet hans la grunnlaget for feltet mikrobiologi og hadde en dyp innvirkning på vår forståelse av den naturlige verden.