En teori er at balalaikaen ble oppfunnet av det russiske folket selv. Dette er basert på det faktum at balalaikaen er et tradisjonelt russisk instrument, og det er bevis på dens eksistens i Russland allerede på 1600-tallet.
En annen teori er at balalaikaen ble oppfunnet av en gruppe russiske musikere kjent som guslarene. Guslarene var omreisende musikere som spilte en rekke strengeinstrumenter, inkludert balalaikaen. De antas å ha spredt kunnskapen om balalaikaen over hele Russland.
Til slutt tror noen at balalaikaen kan ha blitt oppfunnet av en mann ved navn Vasily Andreyev. Andrejev var en russisk musiker og komponist som levde på slutten av 1800-tallet og begynnelsen av 1900-tallet. Han er kreditert med å popularisere balalaikaen og bringe den til verdens oppmerksomhet.
Til syvende og sist kan den sanne oppfinneren av balalaikaen aldri bli kjent. Instrumentet har imidlertid en lang og rik historie, og det fortsetter å bli spilt av musikere over hele verden.