Gjennom hele sangen uttrykker sangeren deres interne konflikt og deres ønske om å finne en måte å dele hemmeligheten deres uten å forårsake smerte eller skuffelse. De synger om tyngden av å bære hemmeligheten og lengselen etter løslatelse og frihet fra byrden ved å beholde den.
Refrenget til sangen understreker det følelsesmessige ved å holde på hemmeligheter, med teksten:
«Jeg er lei av hemmeligheter
Jeg er lei av løgner
Jeg er lei av å late som
Jeg er lei av alt dette"
Sangen antyder at hemmeligheter har makt til å erodere tillit, kvele kommunikasjon og til slutt skade relasjoner. Sangeren uttrykker sitt ønske om ærlighet og åpenhet, og sin tro på at det å møte sannheten, uansett hvor vanskelig det er, til syvende og sist er den beste måten å gå videre og bygge en sterk, ekte forbindelse med noen.
Totalt sett er "Secrets" av OneRepublic en kraftig og introspektiv sang som utforsker den komplekse følelsesmessige dynamikken rundt hemmeligheter og det menneskelige behovet for ærlighet og autentisitet i forhold.