Gjennom hele sangen reflekterer Vedder over forholdet til moren sin, og uttrykker skyldfølelse og anger. Han tenker på ideen om å "holde fast" på minnet hennes og innvirkningen hennes død har etterlatt på livet hans. Tekstene berører også temaer om forløsning og søken etter åndelig veiledning i tider med sorg.
Sangen er også en refleksjon over de komplekse følelsene som følger med å miste en forelder, inkludert sinne, sorg og en lengsel etter fortiden. Refrenget understreker ideen om tilgivelse og det å finne fred, mens Vedder synger:«Jeg er en heldig mann som kan regne på begge hender de jeg elsker».
«Daughter» er en dypt personlig og gripende sang som taler til den universelle opplevelsen av tap og sorg. Den tjener som en påminnelse om den dype innvirkningen en kjæres død kan ha på livene våre, og oppmuntrer oss til å finne trøst i minnene vi har kjære.