Josquins musikk omfatter de fleste sjangrene som var aktuelle på slutten av 1400- og begynnelsen av 1500-tallet. I dag er han mest kjent for sine messer og motetter, hvorav mange blir sett på som mesterverk av renessansens polyfoni, men i løpet av sin levetid ble han nok like aktet som en komponist av chansons; rundt sytti settinger overlever, mer enn noen annen komponist på sin tid. Josquins musikk var kjent i hele det utdannede Europa, og han ble en av de første kjente komponistene siden antikken.