Sangen begynner med en hjemsøkende melodi og en gjentatt bønn, "Når du ikke er der, føler jeg meg alene." Dette setter tonen for sangens utforskning av lengselen etter en større tilstedeværelse i øyeblikk av isolasjon og svakhet.
Gjennom versene reflekterer sangeren over utfordringene og prøvelsene de går gjennom. De føler seg overveldet av omstendighetene, og stiller spørsmål ved om de har styrken til å fortsette. De erkjenner sin avhengighet av noe eller noen som er større enn dem selv, og uttrykker deres behov for veiledning, støtte og utfrielse.
Refrenget fungerer som et vendepunkt i sangen. Den proklamerer:"Når du kommer, er alt i orden." Denne kraftige erklæringen gjenspeiler et skifte i perspektiv når sangeren finner håp og trøst midt i kampene deres. Sangen antyder at tilstedeværelsen av en høyere makt, et guddommelig vesen eller en kilde til styrke kan bringe trygghet og fred selv i de mørkeste øyeblikkene.
I broen erkjenner sangeren usikkerheten og smerten de møter, men de bekrefter sin tro og tillit. Sangen avsluttes med et crescendo av følelser når sangeren erklærer:"Når du kommer, vet jeg at jeg kan klare det."
Totalt sett er "When You" av Skillet en sang som snakker til den menneskelige opplevelsen av å søke styrke, trøst og motstandskraft i tider med motgang. Den fremhever troens transformerende kraft og troen på et større nærvær som kan gi håp og trygghet i møte med livets utfordringer.