Gjennom hele sangen utforsker Roger Waters' tekster ideen om at mennesker blir bare tannhjul i et større mekanisk system. Han synger:"Velkommen min sønn, velkommen til maskinen. Hva drømte du? Det er greit, vi fortalte deg hva du skulle drømme." Dette antyder at individer blir programmert og kontrollert av ytre krefter, og mister sine egne tanker og drømmer i prosessen. Sangen berører også temaene fremmedgjøring, angst og tap av individualitet i et samfunn dominert av teknologi.
Den hjemsøkende musikken, med repeterende rytmer og industrielle lyder, bidrar til den generelle følelsen av ubehag og uro. Sporet bygger i intensitet etter hvert som tekstene blir mer presserende, og kulminerer i det kraftige refrenget, "Er det noen der ute?" Dette spørsmålet går igjen i sangen, og representerer et desperat rop etter menneskelig forbindelse og autentisitet i en verden dominert av maskiner.
"Welcome to the Machine" tjener som en advarsel mot farene ved ukontrollert teknologisk fremskritt og erosjon av menneskelige verdier og individualitet. Den utfordrer lytterne til å reflektere over forholdet til teknologi og stille spørsmål om de virkelig har kontroll over sine egne liv eller om de blir kontrollert av ytre krefter.