Sentrale temaer som utforskes i sangen inkluderer:
Fryktende minner :Taylor Swift bruker levende bilder for å beskrive hvordan minner fra det tidligere forholdet vedvarende dukker opp i hodet hennes, og hjemsøker tankene hennes.
Angrer :Tekstene uttrykker beklagelse over valg som er tatt og muligheter som er gått glipp av under forholdet.
Dvelgende følelser :Sangen formidler følelser av sorg og lengsel som henger igjen selv etter den fysiske separasjonen.
Intern konflikt :Swift beskriver en intern kamp mellom å ønske å holde på fortiden og ønsket om å gå videre og helbrede.
Fryktelig vakkert :Til tross for de smertefulle følelsene, presenterer sangen et uhyggelig vakkert perspektiv på kompleksiteten til kjærlighet, tap og den varige naturen til tidligere opplevelser.
Godsept :Sangen antyder begynnelsen på en reise mot aksept, da sangeren erkjenner at healing kan kreve å gi slipp på fortiden og omfavne fremtiden.
Totalt sett fanger "Haunted" det emosjonelle kjølvannet av et forhold og vanskeligheten med å gi slipp på betydelige opplevelser, og utforsker de langvarige effektene av kjærlighet, tap og hjertesorg.