* Individuelle styrker og svakheter: Ulike Pokémon har forskjellige statistikker, trekk og evner, noe som gjør dem bedre i forskjellige scenarier.
* Opplæring og nivåer: En godt trent Pokémon på høyt nivå vil alltid være sterkere enn en på lavt nivå, uavhengig av art.
* Spillers strategi og ferdigheter: Hvordan en spiller bruker Pokémonen sin i kamp kan i stor grad påvirke effektiviteten deres.
Noen Pokémon blir imidlertid ofte ansett som veldig kraftige i Pokémon Crystal på grunn av deres sterke statistikker og movepools:
* Mewtwo: Uten tvil den kraftigste Pokémon i hele franchisen, Mewtwo er en Psychic-type med utrolig statistikk og tilgang til kraftige trekk som Psychic og Psybeam.
* Tyranitar: Tyranitar er en pseudolegendarisk Pokémon med enormt angrep og forsvar, en styrke å regne med i kamper.
* Gyarados: Med sitt karakteristiske Dragon Dance-trekk kan Gyarados bli utrolig kraftfulle og feie hele lag.
* Dragonite: En annen Pseudo-legendarisk Pokémon, Dragonite er en kraftig flyvende/drage-type med en flott movepool.
* Alakazam: En psykisk type med utrolige spesialangrep, Alakazam kan være utrolig kraftig når den brukes effektivt.
* Snorlax: Selv om det er sakte, har Snorlax utrolig mye HP og forsvar, noe som gjør det vanskelig å ta ned.
Til syvende og sist avhenger den "mektigste" Pokémon i Crystal av individuelle preferanser, spillestil og de spesifikke utfordringene du møter.