For å rekruttere Zapdos må du først rekruttere Articuno og Moltres. Etterpå vil Articuno og Moltres fortelle deg om å dra til Sky-Craggy Isle for å se etter Zapdos.
Når du ankommer Sky-Craggy Isle, vil du se noen skyer truende på himmelen, og du vil bli bedt om å undersøke dem. Når du flyr opp til skyene, vil du bli overfalt av Zapdos. Beseire det, og du vil få muligheten til å invitere Zapdos til laget ditt.