Det er også begrensninger på antall bestemte kort du kan ha i kortstokken din:
* Main Deck: Du kan bare ha 3 kopier av et bestemt kort i hoveddekket ditt, bortsett fra grunnleggende monstre som ikke har noen grense (som "Elemental HERO Shadow Mist").
* Ekstra kortstokk: Antall ekstra kortstokker du kan ha varierer avhengig av formatet. For eksempel, i "Master Duel"-formatet kan du ha 15 kort i din ekstra kortstokk, mens "TCG"-formatet tillater 15 kort i ekstradekket.
Husk at du ikke kan ha mer enn én kopi av et kort i den ekstra kortstokken.