Når et Wonder Card brukes, vil det åpne en spesiell meny der spillere kan velge hendelsen eller mysteriegaven de ønsker å få tilgang til. Begivenheter kan inkludere spesielle Pokémon-distribusjoner eller utfordringer, mens Mystery Gifts kan inkludere gjenstander, Pokémon eller andre belønninger.
For å bruke et Wonder Card, må spillere sørge for at deres Nintendo DS er koblet til internett eller har en lokal trådløs forbindelse etablert. Når de er koblet til, kan de velge Wonder Card fra inventaret og aktivere det for å få tilgang til den tilhørende begivenheten eller Mystery Gift.
Det er verdt å merke seg at Wonder Cards kun var tilgjengelig i en bestemt tidsperiode og for visse arrangementer eller distribusjoner. Noen Wonder-kort kan ha utløpt eller kanskje ikke lenger tilgjengelig, så det er alltid en god idé å sjekke hendelsesdetaljene og tilgjengeligheten før du prøver å bruke et spesifikt Wonder-kort.