Historiens konflikt legger vekt på følelser, hevn og samspillet mellom samfunnsmessige fordommer og indre kamp i stedet for å utforske samspillet mellom menneskeheten og naturen. I tillegg, siden de fleste hendelsene finner sted innenfor Palais Garnier, er de naturlige elementene ikke spesielt fremhevet i denne historien. Derfor er det ikke en konflikt mellom menneskeheten og naturen som driver fortellingen i "The Phantom of the Opera."