1. The Legend of the Hound: Historien begynner med den skremmende legenden om en monstrøs hund, som sies å være forbannelsen til Baskerville-familien. Denne tråden virker i utgangspunktet som en ren folklore, men det blir snart klart at den inneholder en skummel sannhet, som knytter til aktuelle hendelser og nylige dødsfall.
2. Den mystiske døden til Sir Charles: Den plutselige døden til Sir Charles, sjefen for Baskerville-familien, gir næring til den første frykten og mistenksomheten. Den første antagelsen om et hjerteinfarkt utfordres av tilstedeværelsen av et stort, mystisk fotavtrykk og den skumle historien om Sir Charless terror før hans død. Denne tråden driver etterforskningen og setter scenen for Holmes og Watsons ankomst.
3. Stapletons merkelige oppførsel: Den gåtefulle karakteren til Stapleton, en tilsynelatende harmløs naturforsker som bor i nærheten av Baskerville Hall, blir i utgangspunktet presentert som en vennlig nabo. Handlingene hans, spesielt hans interesse for legenden om hunden og hans kunnskap om Sir Charles død, vekker imidlertid tvil om hans sanne intensjoner. Denne tråden fører til at han eventuelt avslører som gjerningsmannen.
Disse tre tilsynelatende separate trådene samles når Holmes avdekker mysteriet. Legenden, dødsfallet og Stapletons oppførsel er alle forbundet med den skumle planen om å arve Baskerville-godset gjennom drap. Å løse gåten innebærer å bringe disse trådene sammen, og kulminere i avdukingen av den sanne naturen til hunden og Stapletons motiver.