I stedet har hver episode typisk en annen drapssak, som ofte involverer en unik og overbevisende morder. Det er tilbakevendende karakterer som fungerer som skurker i flere episoder, men de er ikke hovedfokuset i serien.
Noen av de mest minneverdige tilbakevendende skurker inkluderer:
* Gravediggeren: En seriemorder som begraver sine ofre i forseggjorte, ritualistiske graver.
* Puppeteer: En seriemorder som manipulerer ofrene sine til å drepe seg selv.
* Gormogon: En seriemorder som etterlater kryptiske meldinger og gåter for teamet å løse.
Fokuset for showet er først og fremst på forholdet mellom Dr. Temperance Brennan og spesialagent Seeley Booth, og prosessen med å løse mysteriene som presenteres i hver episode.