Hva skjer på slutten av Special A manga?

På slutten av Special A-mangaen tilstår endelig Hikari Hanazono og Kei Takishima følelsene sine for hverandre. De deler et søtt kyss og begynner offisielt å date. Kei blir også avslørt for å være faren til Hikaris barn, som de kaller Hikari Takishima.

I mellomtiden finner de andre medlemmene av Special A-klassen også lykke. Tadashi Karino og Megumi Yamamoto begynner å date, og Ryuu Misaki og Akira Toudou gifter seg etter hvert. Jun Saeki, som tidligere hadde forlatt skolen, kommer tilbake og det avsløres at han er sønn av skolens rektor, så han blir også med i Special A-klassen.

I de siste kapitlene har Hikari og Kei en konfirmasjonsseremoni, og de drar alle på en hjertevarmende tur sammen. Mangaen avsluttes med hele Special A-klassen lykkelig sammen.