Historien fokuserer på Ru sin reise med selvoppdagelse og hennes offer for å redde prinsen, Fakir, som hun elsker. Hun velger til slutt å leve som "Princess Tutu" -personen, en mektig og uselvisk enhet, i stedet for å forfølge et romantisk forhold.
Mens det er en sterk romantisk understrøm mellom Ru og Fakir, avsluttes historien med at de ikke havner sammen i en tradisjonell romantisk forstand. Dette gir rom for tolkning angående forholdet til forholdet og muligheten for at deres bånd utvikler seg i fremtiden.