Historiske unøyaktigheter: Kritikere hevder at boken og filmen presenterer en rekke historiske unøyaktigheter og overforenklinger av Holocaust. Noen mener det minimerer grusomhetene og kompleksiteten til Holocaust ved å presentere en renset og følelsesmessig manipulerende fremstilling av hendelser.
Mangel på kontekst: Historien mangler tilstrekkelig historisk kontekst til å hjelpe lesere eller seere til å forstå de bredere historiske og politiske omstendighetene som førte til Holocaust. Denne utelatelsen har blitt kritisert for potensielt å villede publikum om folkemordets sanne natur og omfang.
Stereotypiske fremstillinger: Kritikere har hevdet at filmen, spesielt, er avhengig av stereotype representasjoner av nazister som endimensjonale skurker, noe som trekker fra en nyansert forståelse av de komplekse motivasjonene og handlingene til ekte historiske skikkelser.
Emosjonell manipulasjon: Noen kritikere hevder at filmen bevisst manipulerer publikums følelser ved å fokusere på vennskapet mellom Bruno, sønnen til leirkommandanten, og Shmuel, en jødisk gutt fengslet i konsentrasjonsleiren. De hevder at denne sentimentaliserte tilnærmingen bagatelliserer den enorme lidelsen og tapet som millioner av ofre opplevde under Holocaust.
Mangel på byrå for jødiske karakterer: Kritikere hevder at filmen og boken først og fremst fokuserer på perspektivene til Bruno og hans familie, mens jødiske karakterer ofte blir henvist til biroller uten mye dybde eller handlefrihet. Denne kritikken fremhever behovet for mer autentiske og inkluderende representasjoner av jødiske opplevelser under Holocaust.
Oversimplifisering av Holocaust: Kritikere hevder at historiens sentrale premiss, som involverer en ung gutt som blir venn med en jødisk fange, forenkler Holocausts kompleksitet og overser den systematiske dehumaniseringen og utryddelsen av millioner av mennesker.
Upassende målgruppe: Noen kritikere hevder at filmen og boken kanskje ikke passer for yngre publikum på grunn av Holocausts følsomme og urovekkende natur, og antyder at den potensielt kan traumatisere eller forvirre barn uten riktig historisk kontekst og støtte.
Det er viktig å merke seg at denne kritikken ikke nødvendigvis ugyldiggjør den kunstneriske verdien eller personlige svar på boken og filmen. Mange lesere og seere har opplevd at «Gutten i den stripete pyjamasen» er en mektig og rørende historie, mens andre har satt pris på dens innsats for å øke bevisstheten om Holocaust. Kritikken fremhever imidlertid viktige hensyn og diskusjoner rundt historisk nøyaktighet, representasjon og det etiske ansvaret for historiefortelling når man tar opp sensitive historiske hendelser.