* Legion d'honneur (æreslegionen) , den høyeste franske fortjenesteorden, ble tildelt ham i 1878 og 1881.
* Copley-medaljen (1874) , en av de eldste og mest prestisjefylte vitenskapelige prisene fra Royal Society of London.
* Albert-medaljen (1882) , tildelt av Royal Society of Arts som en anerkjennelse for hans enestående bidrag til vitenskap og teknologi.
* Han ble også valgt inn i flere prestisjetunge akademier , inkludert det franske vitenskapsakademiet, Royal Society of London og Académie Française.
Dette er bare noen av de mange prisene og utmerkelsene som Louis Pasteur mottok gjennom hele karrieren. Han regnes som en av de viktigste vitenskapsmennene gjennom tidene, og arbeidet hans har hatt en dyp innvirkning på menneskers helse og velvære.