Vitenskapelig utmerkelse:
* Copley-medalje (1874) :Tildelt av Royal Society of London, en av de mest prestisjefylte vitenskapelige prisene i verden, for sitt arbeid med fermentering og bakterieteorien om sykdom.
* Rumford-medalje (1874) :Tildelt av Royal Society of London for sin forskning på polarisering av lys og dets anvendelser.
* Albert-medaljen (1881) :Tildelt av Royal Society of Arts, for hans bidrag til folkehelse og sykdomsforebygging.
* Knight of the Legion of Honor (1853) :En prestisjetung fransk æresbevisning, tildelt personer som har gitt betydelige bidrag til nasjonen.
* Grand Cross of the Legion of Honor (1881) :Den høyeste rangeringen av Legion of Honour, som anerkjenner Pasteurs eksepsjonelle prestasjoner.
* Medlem av det franske vitenskapsakademiet (1862) :En av de høyeste vitenskapelige utmerkelsene i Frankrike.
* utenlandsk medlem av Royal Society (1869) :En ære som anerkjenner hans bidrag til vitenskap utenfor Storbritannia.
Andre priser:
* Det franske vitenskapsakademiets pris (1856) :Tildelt for sitt arbeid med gjæring.
* Pris fra vitenskapsakademiet i Paris (1862) :Tildelt for sitt arbeid med bakterieteorien om sykdom.
I tillegg til disse spesifikke prisene, mottok Pasteur også en rekke andre utmerkelser og anerkjennelser gjennom karrieren, og befestet hans arv som en av de mest innflytelsesrike forskerne på 1800-tallet.