- Garvan-Olin-medaljen fra American Chemical Society (1983):Denne prestisjetunge prisen anerkjenner fremragende prestasjoner innen kjemi.
- Tolman-medaljen fra Southern California-seksjonen av American Chemical Society (1985):Denne prisen gis til en person som har gitt betydelige bidrag til kjemifeltet.
- The American Association for the Advancement of Science (AAAS) Fellows Award (1987):Denne prisen tildeles personer som har gitt enestående bidrag til å fremme vitenskapen.
- The National Organization for Women (NOW) Woman of the Year Award (1990):Denne prisen anerkjenner kvinners betydelige bidrag på ulike felt.
- L'Oréal-UNESCO For Women in Science Awards (2005):Marie Daly var en av de fem mottakerne av denne prisen, som anerkjenner eksepsjonelle prestasjoner av kvinner innen vitenskapelig forskning.
- The National Medal of Science (2005):Dette er en av de høyeste utmerkelsene tildelt forskere i USA, som anerkjenner deres enestående bidrag til feltet.
Marie M. Dalys prestasjoner og innflytelse innen kjemi har blitt anerkjent og feiret, og prisene hennes tjener som et bevis på hennes eksepsjonelle prestasjoner og bidrag.