Filmen begynner på 1970-tallet da Steve Jobs og Steve Wozniak jobber ut av Jobs foreldres garasje og utvikler Apple I-datamaskinen. Jobs blir vist som en visjonær og perfeksjonist, mens Wozniak er fremstilt som det tekniske geniet bak kreasjonene deres.
I mellomtiden er Bill Gates en frafaller fra Harvard som sammen med barndomsvennen Paul Allen danner Microsoft i 1975. Gates blir fremstilt som en klok forretningsmann med et intenst ønske om å lykkes.
Etter hvert som Apple og Microsoft vokser, øker rivaliseringen mellom Jobs og Gates. Jobs er fast bestemt på å lage en revolusjonerende brukervennlig datamaskin, mens Gates fokuserer på å lage programvare som kan kjøres på hvilken som helst maskinvareplattform.
Filmen forteller om lanseringen av Apples Macintosh i 1984, utviklingen av Microsoft Windows og fremveksten av grafiske brukergrensesnitt (GUI). Det inkluderer også dramatiseringer av viktige hendelser som det berømte "Homebrew Computer Club"-møtet der Jobs først demonstrerer Apple I, "Lisa"-prosjektet, og de juridiske kampene mellom Apple og Microsoft om immaterielle rettigheter.
Gjennom hele filmen fører Jobs' besettelse av perfeksjon og hans kompromissløse holdning ofte til konflikter med hans kolleger og ansatte. Gates på sin side blir vist som en mer pragmatisk og kalkulerende leder som er villig til å inngå kompromisser for å nå sine mål.
"Pirates of Silicon Valley" tilbyr et innsiktsfullt blikk inn i de tidlige dagene av teknologiindustrien, og viser lidenskapen, ambisjonene og rivaliseringen som formet utviklingen av personlige datamaskiner og programvare. Filmen fremhever bidragene til Jobs, Gates og andre visjonære som revolusjonerte den digitale tidsalderen.