Her er en oversikt over hvordan filmen ender:
Spoilervarsel!
* Jake Sullys valg: Etter å ha blitt lammet og sendt til Pandora, velger Jake å permanent overføre bevisstheten sin til Avatar-kroppen. Dette betyr at han aldri vil vende tilbake til sin menneskelige form.
* Kampen om Pandora: Menneskene, ledet av oberst Miles Quaritch, angriper Na'vi og deres hjem, Hometree. Jake, sammen med Neytiri og den andre Na'vi, kjemper hardt tilbake.
* Vendepunktet: I det siste slaget samler Jake, på Toruk, den store leonopteryxen, Na'vi og beseirer Quaritch.
* En ny leder: Med den menneskelige trusselen nøytralisert, blir Jake den nye lederen for Na'vi, og tar på seg rollen som «Toruk Makto».
* Et løfte for fremtiden: Jake og Neytiri har en sønn, noe som gjør ham til et symbol på håp og enhet for Na'vi. Filmen avsluttes med løftet om en ny æra for Na'vi under Jakes ledelse.
Slutten på «Avatar» er bittersøt. Det markerer slutten på en krig og en ny begynnelse for Jake, men det etterlater oss også med vissheten om at han aldri vil se sin menneskelige familie igjen.