Nærmere bestemt får han et kraftig, eksperimentelt medikament kalt APTX 4869 av et medlem av Black Organization ved navn Gin .
Gin lurte Shinichi til å ta stoffet mens han undersøkte organisasjonens aktiviteter. Stoffet var ment å være en dødelig gift, men det slo tilbake, og fikk Shinichi til å krympe i stedet.