Etter Alisons forsvinning et år tidligere, begynner Pretty Little Liars å motta anonyme meldinger fra en som heter "A" som truer med å avsløre deres mørkeste hemmeligheter. Mens jentene prøver å finne ut hvem som står bak disse meldingene, begynner de å avdekke lenge begravde sannheter og står overfor farer som truer livet deres. De må jobbe sammen for å avdekke mysteriet om Alisons forsvinning og avsløre identiteten til "A" før det er for sent.
I løpet av showet dykker løgnerne dypere inn i de komplekse hemmelighetene og dramaet i deres eget liv og deres forhold til deres respektive kjærlighetsinteresser, venner og familiemedlemmer. Gjennom vendinger, vendinger og uventede allianser vever «Pretty Little Liars» et spennende nett av mystikk, spenning og vennskap mens jentene konfronterer fortiden deres, omfavner styrkene sine og konfronterer kreftene som har hjemsøkt dem fra begynnelsen.