* New-Englands Plantation (1630)
* Saken til Gud og hans folk i New-England (1663)
* The Deplorable State of New-England (1662)
* The Works of John Higginson (2 bind, 1971-1973)
Prekener
* En avskjedspreken (1663)
* En preken forkynt ved ordinasjonen av Mr. Samuel Willard (1670)
* En preken forkynt ved ordinasjonen av Mr. Increase Mather (1684)
* En preken forkynt ved ordinasjonen av Mr. Cotton Mather (1685)
Andre skrifter
* Et brev til Kristi kirke i Charlestown (1669)
* Et svar på svaret fra de eldste i kirkene i New-England (1664)
* En vindikasjon av New-England-kirkene (1669)