Esperanza, en innvandrerjente fra Mexico, bor med familien sin i et nedslitt leilighetskompleks i Chicago. Hun føler seg marginalisert og annerledes enn de amerikanske barna som gjør narr av henne for å være meksikansk og for ikke å snakke godt engelsk.
Mens han vandrer i nabolaget, oppdager Esperanza en ledig tomt med fire magre trær. Hun identifiserer seg med disse trærne, siden hun føler seg like liten og ubetydelig i sine nye omgivelser. Hun bestemmer seg for å "adoptere" trærne som sine egne og begynner å besøke dem regelmessig.
Esperanza deler sine hemmeligheter og drømmer med trærne. Når hun får vite om feiringen av de dødes dag fra foreldrene, lager hun et alter for de fire magre trærne. Hun setter lys, ringblomster og godteri på alteret, i håp om at de døde trærne skal komme til live igjen.
Når Esperanza begynner å få venner og tilpasse seg sitt nye liv i USA, fortsetter hun å besøke de fire magre trærne. Trærne, som representerer hennes indre motstandskraft, tjener som en kilde til styrke og trøst for henne under hennes reise med selvoppdagelse og assimilering.
Esperanza flytter til slutt bort fra leilighetskomplekset og mister de fire magre trærne av syne. Imidlertid tar hun lærdommen fra forbindelsen med dem og bærer dem med seg når hun møter nye utfordringer og muligheter i livet.
"Four Skinny Trees" utforsker temaer som identitet, tilhørighet, kulturell assimilering og søken etter et sted å kalle hjem. Den skildrer opplevelsene og følelsene til en ung innvandrerjente som prøver å navigere i to kulturer og finne sin egen stemme i et nytt miljø.